Webapp and CLI tool for Clermont phylotyping E. coli genomes
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cd /path/to/ezclermont/webapp/
docker build -t ezclermont .
docker run -p 5000:5000 ezclermont
docker pull nickp60/ezclermont
run within a python virtualenv
venv ~/ezenv/ -p python3
source ~/ezenv/bin/activate
pip install flask ezclermont biopython
cd /path/to/ezclermont/webapp/
python clermontwebapp.py
Content type
Image
Digest
sha256:ffe90209b…
Size
215.9 MB
Last updated
5 months ago
docker pull nickp60/ezclermont