albicans2021/hisat2_ubuntu repository overview

⁠Dockerfile

FROM ubuntu:22.04

RUN apt-get update && apt-get upgrade -y RUN apt-get -y install unzip python3 python-is-python3

COPY ./tools/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip /usr/local RUN unzip /usr/local/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip -d /usr/local && rm /usr/local/hisat2-2.1.0-Linux_x86_64.zip RUN chmod +x /usr/local/hisat2-2.1.0/hisat2

ENV PATH $PATH:/usr/local/hisat2-2.1.0